RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 DPM3Q9P2X0 92 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 FOXL1Q12952 345 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 FMC1Q96HJ9 113 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 NRN1Q9NPD7 142 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 CRPP02741 224 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 E9PLD3 99 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 GP9P14770 177 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 YPEL4Q96NS1 127 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM178BH3BS89 294 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 METRNQ9UJH8 293 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.53□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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CCBE1-202ENST00000439986 IGHG3P01860 377 aa9.52□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00271P0C7V0 271 aa9.52□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 CA7P43166 264 aa9.52□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.52□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 MDFIQ99750 246 aa9.52□□□□□ -0.88
CCBE1-202ENST00000439986 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 FAM236CP0DP71 79 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 FAM231BA6NCW3 169 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 H3BMM0 161 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 WISP1O95388 367 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 OCC1Q8TAD7 63 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2WQ96B02 151 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF524Q96C55 264 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-53P01767 116 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 YPEL2Q96QA6 119 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 HIGD1CA8MV81 97 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PSG7Q13046 419 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 KLRD1Q13241 179 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 E9PLN8 166 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 RBX1P62877 108 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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CCBE1-202ENST00000439986 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV1-5P01602 117 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.51□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 UQCRQO14949 82 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 KIR3DS1Q14943 382 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV2-5P01817 119 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 CD28P10747 220 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TSKUQ8WUA8 353 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A20O43772 301 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 GZMBP10144 247 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GUT8 65 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 WIPF3A6NGB9 483 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 GYPEP15421 78 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 C2orf82Q6UX34 121 aa9.5□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ERVK11-1P61568 191 aa9.49□□□□□ -0.89
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CCBE1-202ENST00000439986 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ESPL1Q14674 2120 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0G2JRQ6 117 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 HERVK_113P63121 156 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 K7ERS5 55 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 NBR2O15453 112 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.49□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 TIMP3P35625 211 aa9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCBE1-202ENST00000439986 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.48□□□□□ -0.89
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