RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 BUB3O43684 328 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 CD7P09564 240 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 EDN2P20800 178 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 RAB14P61106 215 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 BLOC1S1P78537 153 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 GUCA2BQ16661 112 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 LCN15Q6UWW0 184 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 SMPXQ9UHP9 88 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 CHEK1O14757 476 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 OR7C2O60412 319 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 STAG3L2P0CL84 134 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 STAG3L3P0CL85 134 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 FOLR2P14207 255 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 CBLN1P23435 193 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 TEX46H3BTG2 121 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 CXorf1O96002 111 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 HBE1P02100 147 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 NMBP08949 121 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 GLMPQ8WWB7 406 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 GPR82Q96P67 336 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 PAXXQ9BUH6 204 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GV50 99 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 ZNF785A8K8V0 405 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 OR11H12B2RN74 326 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 GCHFRP30047 84 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 GALR1P47211 349 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 ZNF503Q96F45 646 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 OR51M1Q9H341 326 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 HRH4Q9H3N8 390 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-208ENST00000438888 HELTA6NFD8 242 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 OR10J4P0C629 311 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 PYYP10082 97 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 CLLU1Q5K131 121 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 IL17DQ8TAD2 202 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 FXYD5Q96DB9 178 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 MLXQ9UH92 298 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 CD5P06127 495 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 IGLC2P0DOY2 106 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 PSMB3P49720 205 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 TCF24Q7RTU0 167 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 A0A087X0K7 114 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 H3BQ15 152 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 CCL20P78556 96 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 MEOX2P50222 304 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 PPT1P50897 306 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 PMS2P11Q13670 270 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 GUK1Q16774 197 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 SUN5Q8TC36 379 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 BLNKQ8WV28 456 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-208ENST00000438888 H3BTX0 84 aa9.23□□□□□ -0.93
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