RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF182Q8N6D2 247 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A087X0K7 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 K7EPK0 472 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 M0R2N4 97 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 M0R2Z0 102 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SSSCA1O60232 199 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INSP01308 110 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IFNA21P01568 189 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IL5P05113 134 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00869P0C866 280 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TSPOP30536 169 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SELENOTP62341 195 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BAK1Q16611 211 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF212Q495C1 297 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SMIM8Q96KF7 97 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSENENQ9NZ42 101 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.65□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SMCO3A2RU48 225 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC160A6NGH7 325 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LYRM9A8MSI8 78 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FNDC10F2Z333 226 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HYPMO75409 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCNKO75909 580 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4E1P0C645 316 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HTN3P15516 51 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CXCL3P19876 107 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BTCP35070 178 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAP2BP61225 183 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 B2MP61769 119 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DAD1P61803 113 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DLK1P80370 383 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BAP18Q8IXM2 172 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF738Q8NE65 137 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UHRF2Q96PU4 802 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NACAE9PAV3 2078 aa6.64□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRM2P04554 102 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FGL1Q08830 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRIQKQ629K1 86 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PATE2Q6UY27 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HSPG2P98160 4391 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TSC22D2O75157 780 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5G3P0C626 314 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CXCL2P19875 107 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AZU1P20160 251 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TAS2R30P59541 319 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TEPPQ6URK8 271 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 S100A7AQ86SG5 101 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MITD1Q8WV92 249 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARL6Q9H0F7 186 aa6.62□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C7orf66A4D0T2 115 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 INPP1P49441 399 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TAS2R60P59551 318 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARL16Q0P5N6 197 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSG3Q16557 428 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF546Q86UE3 836 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GGACTQ9BVM4 153 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARV1Q9H2C2 271 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RNF24Q9Y225 148 aa6.61□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.6□□□□□ -1.35
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms