RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 ROS1P08922 2347 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 TAX1BP3O14907 124 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 C12orf74Q32Q52 190 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 PCP2Q8IVA1 136 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 DKK2Q9UBU2 259 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 MYLKQ15746 1914 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PI4KAP42356 2102 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C11orf52Q96A22 123 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SRRM5B3KS81 715 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PRR7Q8TB68 274 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 FNDC10F2Z333 226 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SIVA1O15304 175 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A20O43772 301 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 FGF6P10767 208 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 MORN5Q5VZ52 161 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 GGNQ86UU5 652 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 FAM168AQ92567 244 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PINLYPA6NC86 204 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CCL21O00585 134 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 FCN3O75636 299 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 Q8NFD4 153 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 HAX1O00165 279 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 IGLC1P0CG04 106 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 LINC00158P58513 81 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ZNF876PQ49A33 203 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SBF1O95248 1867 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1-16P04430 117 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ARTNQ5T4W7 220 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C8orf49Q96NF6 230 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SPXQ9BT56 116 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PRSS47A8MTI9 375 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C17orf100A8MU93 164 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TIMM23O14925 209 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 WISP1O95388 367 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CRPP02741 224 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ZNF747Q9BV97 191 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CACNA1EQ15878 2313 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 POLEQ07864 2286 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TET1Q8NFU7 2136 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 VCYO14598 125 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CRYBA4P53673 196 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ATRXP46100 2492 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 H0YJW9 148 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 LINC01587Q99440 93 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 B9A039 149 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PRSS46E5RG02 174 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 NPYP01303 97 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 WFDC2Q14508 124 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 NDUFS7O75251 213 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 HLA-DRB4P13762 266 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ERCC8Q13216 396 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 DEFB123Q8N688 67 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 Q8N8P6 123 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TRACP01848 142 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 BSPH1Q075Z2 132 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 TAL2Q16559 108 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.93□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SRD5A1P18405 259 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 G3V4G9 280 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ZNF524Q96C55 264 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 CFAP161Q6P656 301 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 K7EMI3 77 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 OVOL1O14753 267 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 PAX4O43316 350 aa7.92□□□□□ -1.14
HERC3-202ENST00000402738 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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