RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRK-208ENST00000392449 C7orf66A4D0T2 115 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRK-208ENST00000392449 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRK-208ENST00000392449 H3BTX0 84 aa11.71□□□□□ -0.53
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PTPRK-208ENST00000392449 S100A7P31151 101 aa11.71□□□□□ -0.53
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PTPRK-208ENST00000392449 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.71□□□□□ -0.53
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PTPRK-208ENST00000392449 HTN1P15515 57 aa11.7□□□□□ -0.54
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PTPRK-208ENST00000392449 C16orf74Q96GX8 76 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 IGSF23A1L1A6 192 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 S100A10P60903 97 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 ATG101Q9BSB4 218 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRK-208ENST00000392449 ATP5G1P05496 136 aa11.61□□□□□ -0.55
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