RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.034e-9■■■□□ 18
PTPRK-205ENST00000368213 KNCNA6PVL3 124 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 CIDEAO60543 219 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 MYLKQ15746 1914 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 STAG3L2P0CL84 134 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 PMCHL1Q16048 86 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 NOTCH2Q04721 2471 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 C19orf84I3L1E1 186 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 TCRAP04437 139 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 PAX9P55771 341 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 VOPP1Q96AW1 172 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE12BA1L429 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE7O76087 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE12FP0CL80 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE12GP0CL81 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE12IP0CL82 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GP9P14770 177 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 ERCC8Q13216 396 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 RNF222A6NCQ9 220 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 DKK1O94907 266 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 NDUFA3O95167 84 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 VPS25Q9BRG1 176 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 GTF3C1Q12789 2109 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 FOXE3Q13461 319 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 RNF182Q8N6D2 247 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 PPBPP02775 128 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-205ENST00000368213 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 VSIRQ9H7M9 311 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 SLC25A20O43772 301 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 SH2D1AO60880 128 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 C15orf62A8K5M9 175 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 STAG3L3P0CL85 134 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 LIME1Q9H400 295 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRK-205ENST00000368213 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 GZMBP10144 247 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 PLA2G2AP14555 144 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 SPATA45Q537H7 98 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 IMMP2LQ96T52 175 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRK-205ENST00000368213 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 INAFM1C9JVW0 142 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 C15orf65H3BRN8 121 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 SPRNQ5BIV9 151 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 WFDC1Q9HC57 220 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 C1orf159Q96HA4 380 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 OSTCQ9NRP0 149 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 A0A087WWL8 130 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 H0YIZ8 118 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRK-205ENST00000368213 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 RMI2Q96E14 147 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE12JA6NER3 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE1Q13065 139 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE4Q13068 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE5Q13069 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 SS18Q15532 418 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 GAGE13Q4V321 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 PET117Q6UWS5 81 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 TCF23Q7RTU1 214 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 CGB7P0DN87 165 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM86BQ8N661 226 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 SLURP1P55000 103 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00158P58513 81 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-205ENST00000368213 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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