RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 TRGV9Q99603 122 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1W2PR77 199 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 LILRA1O75019 489 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM258P61165 79 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1W2PPM0 123 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 E9PQ18 207 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHG4P01861 327 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00205P59089 165 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SLAQ13239 276 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 UTF1Q5T230 341 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 ARMS2P0C7Q2 107 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SPSB3Q6PJ21 355 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 INAFM2P0DMQ5 153 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DKK1O94907 266 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 THBDP07204 575 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CARD19Q96LW7 228 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 B5MCH6 92 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 H3BMG7 143 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CRLF1O75462 422 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 C15orf53Q8NAA6 179 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 ETDBQ3ZM63 59 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CT83Q5H943 113 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 MMP23AO75900 390 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGKV1D-12P01611 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NRN1LQ496H8 165 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 LIME1Q9H400 295 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGKV1-5P01602 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CRYBA4P53673 196 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 Q86TA4 180 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NMSQ5H8A3 153 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 AKAP6Q13023 2319 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 WIPF3A6NGB9 483 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SP9P0CG40 484 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 MLANAQ16655 118 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CACNA1EQ15878 2313 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHV1-46P01743 117 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 THAP8Q8NA92 274 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 KNCNA6PVL3 124 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 Q0VG73 95 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 Q6ZWC4 215 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 METRNQ9UJH8 293 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NXPH4O95158 308 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 QRFPP83859 136 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 SHISA9B4DS77 424 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CD177Q8N6Q3 437 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.97□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 H0YJW9 148 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 CFPP27918 469 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM141Q96I45 108 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB130BP0DP73 79 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB130AP0DP74 79 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 NBL1P41271 181 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 MPDZO75970 2070 aa8.96□□□□□ -0.97
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.96□□□□□ -0.98
GTF3C1-201ENST00000356183 IL18BPO95998 194 aa8.96□□□□□ -0.98
GTF3C1-201ENST00000356183 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.96□□□□□ -0.98
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLC2P0DOY2 106 aa8.96□□□□□ -0.98
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLC3P0DOY3 106 aa8.96□□□□□ -0.98
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.96□□□□□ -0.98
GTF3C1-201ENST00000356183 PINLYPA6NC86 204 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms