RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.77■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.77■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF785A8K8V0 405 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 F6UZH7 168 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM250H0YL14 139 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CEBPGP53567 150 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C17orf77Q96MU5 243 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ATRQ13535 2644 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087X0K7 114 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf70A6NJV1 201 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFB4O95168 129 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 EDN2P20800 178 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC28AQ8IWP9 274 aa15.75■□□□□ 0.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00052Q96N35 136 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 Q9H3A6 140 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 HELTA6NFD8 242 aa15.75■□□□□ 0.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 SLC17A3O00476 420 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 MEOX2P50222 304 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 LYPD1Q8N2G4 141 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 M0QZ24 198 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF253O75346 499 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CBLN1P23435 193 aa15.74■□□□□ 0.11
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PACSIN3-201ENST00000298838 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC11CQ9BY50 192 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 OTORQ9NRC9 128 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCYAP1P18509 176 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PSG9Q00887 426 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TCEAL7Q9BRU2 100 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 AAMDCQ9H7C9 122 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SCO2A0A1W2PP80 73 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 PGPA6NDG6 321 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 FOLR2P14207 255 aa15.73■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15.72■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa15.72■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C5orf17Q8NAS9 161 aa15.72■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf52Q96A22 123 aa15.72■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.71■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 TCF24Q7RTU0 167 aa15.71■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CITED1Q99966 193 aa15.71■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.71■□□□□ 0.11
PACSIN3-201ENST00000298838 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.71■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.71■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.7■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 NRN1Q9NPD7 142 aa15.7■□□□□ 0.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 OVOL1O14753 267 aa15.69■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.69■□□□□ 0.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 MLXQ9UH92 298 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 EPDR1Q9UM22 224 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PEX7O00628 323 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 APOC3P02656 99 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CSN3P07498 182 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 GNG5P63218 68 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 DERL1Q9BUN8 251 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 RPH3ALQ9UNE2 315 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.68■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.67■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF727A8MUV8 499 aa15.67■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PF4P02776 101 aa15.67■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.67■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ATG101Q9BSB4 218 aa15.67■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 AKR1C3P42330 323 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 C16orf92Q96LL3 132 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R3E3 92 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 TCRAP04437 139 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CSN1S1P47710 185 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC5AQ9NY25 188 aa15.66■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMD13Q5VXD3 122 aa15.65■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 IGFL4Q6B9Z1 124 aa15.65■□□□□ 0.1
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 SOCS3O14543 225 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL35P42766 123 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF182Q8N6D2 247 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 PRELID1Q9Y255 219 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 SVBPQ8N300 66 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.64■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 ISLRO14498 428 aa15.63■□□□□ 0.09
PACSIN3-201ENST00000298838 HLA-DMBP28068 263 aa15.63■□□□□ 0.09
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