RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	PDCD6	O75340	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	DEFA4	P12838	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CEND1	Q8N111	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		K7EMI3	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	GFER	P55789	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HCFC1	P51610	2035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP5G1	P05496	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CD7	P09564	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		Q9H8V8	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HAX1	O00165	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	BGLAP	P02818	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CACNG7	P62955	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	QRFP	P83859	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		C9JCJ5	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF137P	P52743	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF138	P52744	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HERVK_113	P61574	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PAX8	Q06710	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CST6	Q15828	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	KNTC1	P50748	2209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PSPN	O60542	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PPY	P01298	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	MPV17	P39210	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM23	O14925	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF56	Q15929	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZS92	163 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FREM3	P0C091	2139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072		M0R2P5	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	COX6A1	P12074	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PLA2G5	P39877	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MGST3	O14880	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LYPD3	O95274	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	GCHFR	P30047	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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