RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ORM2P19652 201 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 GGNBP1Q5YKI7 109 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 LYZL2Q7Z4W2 148 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0B4J2A0 478 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 IAPPP10997 89 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5I1Q13606 314 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf74Q96GX8 76 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf77Q96MU5 243 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM147Q9BVK8 224 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SHPKQ9UHJ6 478 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAIN1P0CW23 69 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1C4P17516 323 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP8Q8NA92 274 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR82Q96P67 336 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRT1Q99946 306 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC45A2Q9UMX9 530 aa19.03■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A7P31151 101 aa19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R60P59551 318 aa19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM256Q8N2U0 113 aa19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFCQ8NFQ6 507 aa19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4D5Q8NGN0 318 aa19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 Q9H3A6 140 aa19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
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CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM144Q7Z5S9 345 aa19.01■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51S1Q8NGJ8 323 aa19.01■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YY99 117 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 BTF3P20290 206 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
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CAPNS1-217ENST00000629983 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10J6PQ8NGY7 276 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS5O15539 181 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 INAFM2P0DMQ5 153 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA3P12429 323 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF586Q9NXT0 402 aa18.99■□□□□ 0.63
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CAPNS1-217ENST00000629983 M6PRP20645 277 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1C1Q04828 323 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RXFP4Q8TDU9 374 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM4Q8WVI0 70 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB3A2Q96PL1 93 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPQ1 181 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF493Q6ZR52 646 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8A1Q8NGG7 326 aa18.96■□□□□ 0.63
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CAPNS1-217ENST00000629983 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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CAPNS1-217ENST00000629983 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RPP30P78346 268 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ESRGQ1W209 222 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MCUBQ9NWR8 336 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BRN7 92 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RAP2BP61225 183 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 IL18Q14116 193 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF503Q96F45 646 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 MED6O75586 246 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL7P18124 248 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKN1BP46527 198 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE12BA1L429 117 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SMCO3A2RU48 225 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE7O76087 117 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE12FP0CL80 117 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE12GP0CL81 117 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE12IP0CL82 117 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL3P19876 107 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00315P59091 139 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG3Q16557 428 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 H7BYZ3 331 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 WRBO00258 174 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CTF1Q16619 201 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CTDSP2O14595 271 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 EREGO14944 169 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PITX3O75364 302 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 RLN2P04090 185 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 IL5P05113 134 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5G3P0C626 314 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA5P20719 270 aa18.89■□□□□ 0.61
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