RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 A0A0J9YX75 114 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 UPK1BO75841 260 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SCGB1D2O95969 90 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 LINC00869P0C866 280 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ORM2P19652 201 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 IL15RAQ13261 267 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 VWC2Q2TAL6 325 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ZNF709Q8N972 641 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C2orf50Q96LR7 162 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C17orf77Q96MU5 243 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SMCO3A2RU48 225 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 L7N2F9 121 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PRAF2O60831 178 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 B2MP61769 119 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 VAMP2P63027 116 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PSG9Q00887 426 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RAB31Q13636 194 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C16orf92Q96LL3 132 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 LINC00052Q96N35 136 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RSG1Q9BU20 258 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 DOK5Q9P104 306 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C5orf51A6NDU8 294 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 AGPAT2O15120 278 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 MPDU1O75352 247 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 CCNKO75909 580 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 S100A11P31949 105 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 HBG1P69891 147 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 HBG2P69892 147 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ARL16Q0P5N6 197 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ATP6V1FQ16864 119 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 AMTNQ6UX39 209 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ARV1Q9H2C2 271 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A22Q9H936 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 BATF3Q9NR55 127 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 XCL2Q9UBD3 114 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RYR1P21817 5038 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 CCSO14618 274 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 GOSR2O14653 212 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SULT1A1P50225 295 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PRR20EP86478 221 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PRR20CP86479 221 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PRR20DP86480 221 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PRR20BP86481 221 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PRR20AP86496 221 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 OXA1LQ15070 435 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 FAM78BQ5VT40 261 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 LCN15Q6UWW0 184 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PATE2Q6UY27 113 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 STX12Q86Y82 276 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ENKURQ8TC29 256 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 FAM210BQ96KR6 192 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 C20orf173Q96LM9 149 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 PFDN5Q99471 154 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 MGST2Q99735 147 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RNF126Q9BV68 326 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 NMES1Q9C002 83 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 ARL6Q9H0F7 186 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 RFNGQ9Y644 331 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-218ENST00000629219 FAM25EA8MYX2 175 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 ZNF253O75346 499 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 OR5G3P0C626 314 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CXCL3P19876 107 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 HLA-DMBP28068 263 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-218ENST00000629219 CAMLGP49069 296 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms