RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 H3BP45 60 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 HOXB5P09067 269 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 DAD1P61803 113 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.71□□□□□ -0.05
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TRAPPC3-208ENST00000616074 AKR1C1Q04828 323 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF212Q495C1 297 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.7□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR82Q96P67 336 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 H3BRN7 92 aa14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-208ENST00000616074 INSP01308 110 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-208ENST00000616074 S100A7P31151 101 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ADAP1O75689 374 aa14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-208ENST00000616074 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAP2BP61225 183 aa14.63□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DEFB130BP0DP73 79 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEFB130AP0DP74 79 aa14.62□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ATG101Q9BSB4 218 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC160A6NGH7 325 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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