RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 RASL11AQ6T310 242 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 TIMP3P35625 211 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 NDPQ00604 133 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A45Q8N413 288 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRJ-207ENST00000613246 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.41■□□□□ 0.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF138P52744 262 aa15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJ-207ENST00000613246 TIAF1O95411 115 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 THBDP07204 575 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 LYNX1G3V0Z9 82 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 LYNX1P0DP58 116 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 Q8TAT8 98 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 GAS1P54826 345 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 LIME1Q9H400 295 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PPI3 338 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.32■□□□□ 0.04
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