RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.88□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 C15orf62A8K5M9 175 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5G3P48201 142 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 CKS1BP61024 79 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 COX19Q49B96 90 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.87□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.86□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 DUX3Q96PT4 197 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.84□□□□□ -0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 TYMSP04818 313 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 MIC13Q5XKP0 118 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 TREML4Q6UXN2 200 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4A16Q8NH70 328 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf95Q9H693 158 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGEF1-209ENST00000607882 CT45A7P0DMV0 189 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 AREGP15514 252 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGEF1-209ENST00000607882 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 HPRT1P00492 218 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 GCGP01275 180 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXL15Q9H469 300 aa9.81□□□□□ -0.84
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