RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 BMPR1BO00238 502 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 GNG7O60262 68 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF253O75346 499 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2J3O76001 311 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 HLA-DRB1P01911 266 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB4AP20338 218 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 SRIP30626 198 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 MFAP4P55083 255 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 HBBP68871 147 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE6HQ13956 83 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP35Q8NFH5 326 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF125Q96EQ8 232 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 C14orf144Q96I85 54 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 NEU1Q99519 415 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-222ENST00000592408 HIGD1CA8MV81 97 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK4O60575 86 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1-17P01599 117 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM106CPP0CH98 169 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM11P17152 192 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 AMTP48728 403 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 DLX1P56177 255 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35B1P78383 322 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6AWC8 147 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 RAX2Q96IS3 184 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00479Q96M42 142 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TBX15Q96SF7 602 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TXN2Q99757 166 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 VAMP8Q9BV40 100 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 MLST8Q9BVC4 326 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 IGF2RP11717 2491 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GUS0 222 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GW15 77 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 IL4P05112 153 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 CT45A10P0DMU9 189 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 MED14OSP0DP75 135 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 CSN1S1P47710 185 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 EFNA4P52798 201 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 PSG9Q00887 426 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 KLRD1Q13241 179 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 EBI3Q14213 229 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 Q56UQ5 140 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZWC4 215 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 BORCS7Q96B45 105 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 X6R8D5 127 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GXF2 115 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NNC1 897 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 CHEK1O14757 476 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 HSBP1O75506 76 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 GOSR1O95249 250 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 GPX1P07203 203 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLC2P0DOY2 106 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 PMCHP20382 165 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00310P59036 64 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTDAPP60985 99 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 LEMD1Q68G75 181 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N6K4 173 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 PRORYQ9H606 182 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-222ENST00000592408 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 181.7 ms