RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MEOX2P50222 304 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP8Q8NA92 274 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM63Q969Q1 353 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A22Q9H936 323 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 IAPPP10997 89 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG101Q9BSB4 218 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 RSG1Q9BU20 258 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf90A8MZG2 172 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R2Z0 102 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CRXO43186 299 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GALR1P47211 349 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CNN1P51911 297 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINK13Q1W4C9 94 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP1BQ9NZR2 4599 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF98A6NK75 572 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PITX3O75364 302 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ASAH1Q13510 395 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFL4Q6B9Z1 124 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11H7Q8NGC8 314 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SCGB3A2Q96PL1 93 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PTTG1O95997 202 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB11AP62491 216 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPXP78539 464 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNRF2Q8NHG8 242 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DEDD2Q8WXF8 326 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MCUBQ9NWR8 336 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 LYRM9A8MSI8 78 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 INSP01308 110 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB130BP0DP73 79 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB130AP0DP74 79 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA3P12429 323 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 AP3S2P59780 193 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 BAP18Q8IXM2 172 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC45A2Q9UMX9 530 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAC8L1A1L4L8 177 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS46E5RG02 174 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK2AP2O75956 126 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GGNBP1Q5YKI7 109 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF182Q8N6D2 247 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CFDP00746 253 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ORM2P19652 201 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 AZU1P20160 251 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FCN2Q15485 313 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf223Q8N319 242 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4D5Q8NGN0 318 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H768 121 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT3O95989 172 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MZT2BQ6NZ67 158 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1B1Q8NGR6 318 aa17.97■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPXA8MT69 81 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPOP30536 169 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G10O15496 165 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 LYRM1O43325 122 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFCQ8NFQ6 507 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM147Q9BVK8 224 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 NAP1L6A6NFF2 107 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 B2MP61769 119 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FGL1Q08830 312 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED4Q7Z7H5 227 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR82Q96P67 336 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00588Q9Y4M8 146 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A6P12236 298 aa17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FAUP35544 74 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BRN7 92 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 WRBO00258 174 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MED6O75586 246 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5G1P05496 136 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5G3P48201 142 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL18P55774 89 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 LRTM2Q8N967 370 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF738Q8NE65 137 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF141Q8WVD5 230 aa17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNGR2O43760 224 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1C1Q04828 323 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM128Q5BJH2 165 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ENKURQ8TC29 256 aa17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBP04114 4563 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CBY3A6NI87 242 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BP45 60 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 VAMP1P23763 118 aa17.9■□□□□ 0.46
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