RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	NDUFA4	O00483	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CSN3	P07498	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZP3	P21754	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	NPPC	P23582	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	TFPI2	P48307	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SULT1A2	P50226	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	DEFB1	P60022	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	PLP1	P60201	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SELENOT	P62341	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CCL20	P78556	96 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	METTL26	Q96S19	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	MLX	Q9UH92	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162		H3BQ15	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	LGALS9	O00182	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CHEK1	O14757	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FABP1	P07148	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FOLR2	P14207	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	IGLL1	P15814	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	M6PR	P20645	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	C4BPB	P20851	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CBLN1	P23435	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CRYBB3	P26998	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	UBE2G2	P60604	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RNF2	Q99496	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162		A0A1W2PPV4	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162		A8MWP6	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SLC17A3	O00476	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	BUB3	O43684	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR7C2	O60412	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SAP30	O75446	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	NMB	P08949	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	GP9	P14770	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RHOB	P62745	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SERF2	P84101	59 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	PFDN5	Q99471	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ASCL2	Q99929	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CAPNS1-208	ENST00000589162	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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