RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 MLXQ9UH92 298 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 HELTA6NFD8 242 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SULT1A2P50226 295 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 MORN5Q5VZ52 161 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PPV4 95 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TAS2R45P59539 299 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 LEMD1Q68G75 181 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TEX261Q6UWH6 196 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A22Q9H936 323 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SORL1Q92673 2214 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TSPAN4O14817 238 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 STAG3L2P0CL84 134 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 STAG3L3P0CL85 134 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 GALR1P47211 349 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 ZNF726P1Q15940 193 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 KHDC3LQ587J8 217 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TCF24Q7RTU0 167 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 RAB24Q969Q5 203 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.67□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 A0A087X0K7 114 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IGLC2P0DOY2 106 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 GP9P14770 177 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IGLL1P15814 213 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 MEOX2P50222 304 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 RNF141Q8WVD5 230 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 ZNF503Q96F45 646 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 C17orf77Q96MU5 243 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 OR51M1Q9H341 326 aa8.66□□□□□ -1.02
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GGA3-211ENST00000582232 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IFNA7P01567 189 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 FHITP49789 147 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 GUK1Q16774 197 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 LCN12Q6JVE5 192 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-211ENST00000582232 SSX7Q7RTT5 188 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SUN5Q8TC36 379 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 PAXXQ9BUH6 204 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 NRN1Q9NPD7 142 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-211ENST00000582232 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF785A8K8V0 405 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 OR7C2O60412 319 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF253O75346 499 aa8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-211ENST00000582232 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 PDE6HQ13956 83 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 DCANP1Q8TF63 244 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 FXYD5Q96DB9 178 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 H3BQ15 152 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 K7EQG2 157 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 SOCS3O14543 225 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.63□□□□□ -1.03
GGA3-211ENST00000582232 PYYP10082 97 aa8.63□□□□□ -1.03
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