RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 IGLV2-8P01709 118 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CD2P06729 351 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 COX4I1P13073 169 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HLA-DRB4P13762 266 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SERPINB10P48595 397 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 MNAT1P51948 309 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PPP3R1P63098 170 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ASAH1Q13510 395 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF773Q6PK81 442 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 Q8N814 137 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ISOC2Q96AB3 205 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CYYR1Q96J86 154 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.39□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HSBP1O75506 76 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CFC1BP0CG36 223 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CFC1P0CG37 223 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HLA-GP17693 338 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CELP19835 753 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 M6PRP20645 277 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 Q56UQ5 140 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF709Q8N972 641 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 BANF2Q9H503 90 aa3.38□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 RAB19A4D1S5 217 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 J3QRE1 110 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 K7EIM0 57 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DCTN3O75935 186 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 FAM107AO95990 144 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DEFB130BP0DP73 79 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DEFB130AP0DP74 79 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CRHBPP24387 322 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TSPOP30536 169 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PSG3Q16557 428 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PSMG4Q5JS54 123 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 C12orf73Q69YU5 71 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 Q6ZN92 141 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF546Q86UE3 836 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 Q96MT0 163 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 V9GY05 133 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DAPL1A0PJW8 107 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 J3QLW9 94 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 M0R129 80 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF253O75346 499 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF19P17023 458 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PRR4Q16378 134 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 SYS1Q8N2H4 156 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 OR4S2Q8NH73 311 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 HIST1H4GQ99525 98 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 TMBIM4Q9HC24 238 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 BET1LQ9NYM9 111 aa3.36□□□□□ -1.87
TRIM25-208ENST00000574234 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms