RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 GABARAPO95166 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 PMP2P02689 132 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R46P59540 309 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TRIM16LQ309B1 348 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 BSXQ3C1V8 233 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 C2orf83Q53S99 150 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZRU5 148 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 RNF182Q8N6D2 247 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.43□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 PRO0255Q9UI72 69 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 FUT9Q9Y231 359 aa6.43□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 RGS10O43665 173 aa6.42□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 TNFSF8P32971 234 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SPCS3P61009 180 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TSPAN5P62079 268 aa6.42□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.42□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV2-11P01706 119 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-53P01767 116 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01620Q4KN68 170 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC190Q86UF4 302 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35E1Q96K37 410 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 DUSP21Q9H596 190 aa6.41□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 A0A0A6YYH2 397 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 A6NJ64 397 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 LECT2O14960 151 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 PRAF2O60831 178 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 NXPH3O95157 252 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1-5P01602 117 aa6.4□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 GABARAPL2P60520 117 aa6.4□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 C22orf42Q6IC83 251 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 FAM219AQ8IW50 185 aa6.39□□□□□ -1.39
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SMAD3-211ENST00000559460 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.39□□□□□ -1.39
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SMAD3-211ENST00000559460 CACNG5Q9UF02 275 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WXM4 84 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD3-211ENST00000559460 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD3-211ENST00000559460 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 BATF3Q9NR55 127 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 K7EQD1 137 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 HRH1P35367 487 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.37□□□□□ -1.39
SMAD3-211ENST00000559460 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.37□□□□□ -1.39
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