RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 OR4C46A6NHA9 309 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 H3BTX0 84 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SYNGR2O43760 224 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 B3GALNT1O75752 331 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 UPK1BO75841 260 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CST7O76096 145 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM50AO95807 157 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IFNA21P01568 189 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV1-17P01599 117 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TCRBP04435 133 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IGLC1P0CG04 106 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 VPREB1P12018 145 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ORM2P19652 201 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 BCAP31P51572 246 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CAV2P51636 162 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB131AP59861 70 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IFITM3Q01628 133 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 FGL1Q08830 312 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF846Q147U1 533 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 BSXQ3C1V8 233 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf83Q53S99 150 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 PSMG4Q5JS54 123 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 IL22RA2Q969J5 263 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 UHRF2Q96PU4 802 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 METTL26Q96S19 204 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 PSENENQ9NZ42 101 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 SMPXQ9UHP9 88 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-204ENST00000558666 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0J9YWU9 116 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 F6UB75 175 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 K7EPK0 472 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 L7N2F9 121 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 SCGB2A1O75556 95 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 MED6O75586 246 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 OR5G3P0C626 314 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 C4BPBP20851 252 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 NPPCP23582 126 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 AMTP48728 403 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 RAB11AP62491 216 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 GAMTQ14353 236 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 RNF182Q8N6D2 247 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 OR4X1Q8NH49 305 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 OR52E5Q8NH55 327 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 THAP6Q8TBB0 222 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 S100ZQ8WXG8 99 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 MARC2Q969Z3 335 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00052Q96N35 136 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC32Q9BV29 185 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 IGSF23A1L1A6 192 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 HELTA6NFD8 242 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS46E5RG02 174 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 VCYO14598 125 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 SSNA1O43805 119 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 PITX3O75364 302 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00869P0C866 280 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 RD3LP0DJH9 198 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 C8orf88P0DMB2 117 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A4P12235 298 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-DMBP28068 263 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 BAXQ07812 192 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 ARL16Q0P5N6 197 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE2BQ13066 116 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 ASAH1Q13510 395 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-204ENST00000558666 CLINT1Q14677 625 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms