RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC22A5	O76082	557 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TOMM40	O96008	361 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	KRAS	P01116	189 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	UBB	P0CG47	229 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LIMS3	P0CW19	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LIMS4	P0CW20	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PI3	P19957	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	VAMP1	P23763	118 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	OPRK1	P41145	380 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NOXA1	Q86UR1	476 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM80	Q96HE8	168 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00479	Q96M42	142 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617		Q9H521	79 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	COMMD9	Q9P000	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PRND	Q9UKY0	176 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ATG12	O94817	140 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	MYL12A	P19105	171 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10J1	P30954	320 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RND2	P52198	227 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	DUSP21	Q9H596	190 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SCN3B	Q9NY72	215 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	GGTLC3	B5MD39	225 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SNAPC5	O75971	98 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SLPI	P03973	132 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PSG1	P11464	419 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ETV1	P50549	477 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TCL1A	P56279	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC58	Q4VC31	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RMI2	Q96E14	147 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	CNBD2	Q96M20	576 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PTGES3L	E9PB15	166 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ERVK-16	P61578	105 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZRP5	223 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	AHSA2	Q719I0	299 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM19	Q96E16	107 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RSG1	Q9BU20	258 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	P2RY14	Q15391	338 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TOR2A	Q5JU69	321 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZS49	121 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LCE2B	O14633	110 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	MYL12B	O14950	172 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RGS10	O43665	173 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	CD1A	P06126	327 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	RD3L	P0DJH9	198 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	WNT4	P56705	351 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	GABARAPL2	P60520	117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZQT7	251 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIM63	Q969Q1	353 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	MND1	Q9BWT6	205 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	KLK12	Q9UKR0	248 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617		M0R2T5	61 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	PTHLH	P12272	177 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LPAR6	P43657	344 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SPHAR	Q15513	63 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MAJIN	Q3KP22	176 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	STPG4	Q8N801	248 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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