RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553726.5

PRKCH-205, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 5

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-205	ENST00000553726	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	S100A7	P31151	101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	CCR6	P51684	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	OXA1L	Q15070	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726		A0A0B4J2A0	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	RGS5	O15539	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	ANXA3	P12429	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	AKR1C4	P17516	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	PSMB3	P49720	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	MEOX2	P50222	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SRPX	P78539	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	CTF1	Q16619	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	RNF212	Q495C1	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	LGI3	Q8N145	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCH-205	ENST00000553726	HERC2	O95714	4834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726		A0A1B0GVY2	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	ISLR	O14498	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	HBE1	P02100	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	PAX9	P55771	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	B2M	P61769	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RAB11A	P62491	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	PSG9	Q00887	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	CTDSP2	O14595	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	MED6	O75586	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	EMP1	P54849	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	IL18	Q14116	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	GAMT	Q14353	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	GPR82	Q96P67	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	TRGV9	Q99603	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RBKS	Q9H477	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726		A0A0J9YX75	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726		M0R2N4	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	SOCS3	O14543	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	RTL8C	O15255	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	SLC25A6	P12236	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	GALR1	P47211	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	LYZ	P61626	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	ZNF90	Q03938	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	ZNF79	Q15937	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCH-205	ENST00000553726	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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