RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	IL5	P05113	134 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	LINC00869	P0C866	280 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ORM2	P19652	201 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	HLA-DMB	P28068	263 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RAB32	Q13637	225 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SLC35E1	Q96K37	410 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	MGST2	Q99735	147 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1W2PS18	150 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SMCO3	A2RU48	225 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF98	A6NK75	572 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048		H3BMM0	161 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048		H3BTX0	84 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	IFNA21	P01568	189 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	H2BFS	P57053	126 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	FXYD7	P58549	80 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RAB11A	P62491	216 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	DLK1	P80370	383 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048		Q6ZWC4	215 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	NOXA1	Q86UR1	476 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF709	Q8N972	641 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	S100Z	Q8WXG8	99 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	NRN1	Q9NPD7	142 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	HELT	A6NFD8	242 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048		H3BRN7	92 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	GOSR2	O14653	212 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	TSC22D2	O75157	780 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	DEDD	O75618	318 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	GYPE	P15421	78 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	BMI1	P35226	326 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	APOC4	P55056	127 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	TAS2R30	P59541	319 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	PAFAH1B2	P68402	229 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	NHLH2	Q02577	135 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	AKR1C1	Q04828	323 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048		Q5BKY6	102 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	MIC13	Q5XKP0	118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048		Q8NAQ8	132 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	OR11H2	Q8NH07	326 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	LINC00052	Q96N35	136 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM2-234	ENST00000546048	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83

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