RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C16orf92Q96LL3 132 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A22Q9H936 323 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RPRMQ9NS64 109 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 PSENENQ9NZ42 101 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 DOK5Q9P104 306 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RFNGQ9Y644 331 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GVY2 172 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM189A5PLL7 270 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BRN7 92 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 PLA2G10O15496 165 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 GALR1P47211 349 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 MEOX2P50222 304 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 OXA1LQ15070 435 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.38□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 K7EPK0 472 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 AKR1C1Q04828 323 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF182Q8N6D2 247 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 MITD1Q8WV92 249 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR82Q96P67 336 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 FNDC10F2Z333 226 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RTL8CO15255 209 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SSSCA1O60232 199 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 HYPMO75409 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IL5P05113 134 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 DLK1P80370 383 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM210BQ96KR6 192 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 UHRF2Q96PU4 802 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.36□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087X0K7 114 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C7orf66A4D0T2 115 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R2Z0 102 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IFNA21P01568 189 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 HBE1P02100 147 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00869P0C866 280 aa8.35□□□□□ -1.07
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CLSTN3-211ENST00000541667 FAM231AP0DMU4 169 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM231CP0DMU5 169 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IL7P13232 177 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 CXCL3P19876 107 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 AZU1P20160 251 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TAS2R30P59541 319 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SELENOTP62341 195 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIQKQ629K1 86 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 BATF3Q9NR55 127 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.35□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SMCO3A2RU48 225 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TSC22D2O75157 780 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 RRN3P1Q2M238 152 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C4orf46Q504U0 113 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZR54 194 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.34□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R2N4 97 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5G3P0C626 314 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RAP2BP61225 183 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 FGL1Q08830 312 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 IL15RAQ13261 267 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PSG3Q16557 428 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 MORN5Q5VZ52 161 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ARL6Q9H0F7 186 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ARV1Q9H2C2 271 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.33□□□□□ -1.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NACAE9PAV3 2078 aa8.33□□□□□ -1.08
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