RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 L7N2F9 121 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SOCS3O14543 225 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PLA2G10O15496 165 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 DEDDO75618 318 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 CCNKO75909 580 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TCRBP04435 133 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 LINC00869P0C866 280 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PAX9P55771 341 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 VAMP2P63027 116 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 DLK1P80370 383 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PSG9Q00887 426 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TEPPQ6URK8 271 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 S100A7AQ86SG5 101 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 MITD1Q8WV92 249 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ARL6Q9H0F7 186 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 HERC2O95714 4834 aa6.5□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 A0A0J9YX75 114 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 CCSO14618 274 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 GOSR2O14653 212 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TSC22D2O75157 780 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 BCAP31P51572 246 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SELENOTP62341 195 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 C12orf74Q32Q52 190 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 C20orf173Q96LM9 149 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 UHRF2Q96PU4 802 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 APLNQ9ULZ1 77 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 CELA1Q9UNI1 258 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 C7orf66A4D0T2 115 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TMEM189A5PLL7 270 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R30P59541 319 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RNF182Q8N6D2 247 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF709Q8N972 641 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 NEU1Q99519 415 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 NUDT15Q9NV35 164 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RNF24Q9Y225 148 aa6.48□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 FNDC10F2Z333 226 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 H3BRN7 92 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 AGPAT2O15120 278 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 HBE1P02100 147 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 CAV2P51636 162 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 PLP1P60201 277 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RHOBP62745 196 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RAB31Q13636 194 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RRN3P1Q2M238 152 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF738Q8NE65 137 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 GGACTQ9BVM4 153 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 ARV1Q9H2C2 271 aa6.47□□□□□ -1.37
LMO3-222ENST00000540445 RFNGQ9Y644 331 aa6.47□□□□□ -1.37
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LMO3-222ENST00000540445 K7EPK0 472 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRR20EP86478 221 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRR20CP86479 221 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRR20DP86480 221 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRR20BP86481 221 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PRR20AP86496 221 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ARL16Q0P5N6 197 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 PATE2Q6UY27 113 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZRG5 221 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 ZNF546Q86UE3 836 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-222ENST00000540445 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.46□□□□□ -1.38
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