RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	GP9	P14770	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ATR	Q13535	2644 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ELANE	P08246	267 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NPPC	P23582	126 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PSMB8	P28062	276 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	METTL26	Q96S19	204 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	HELT	A6NFD8	242 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CRYBB3	P26998	211 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	FOXE3	Q13461	319 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ADIRF	Q15847	76 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610		Q8N2B8	174 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PGP	A6NDG6	321 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	NDUFA4	O00483	81 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CRYBA1	P05813	215 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SRD5A1	P18405	259 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GPR82	Q96P67	336 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610		A0A087WWC5	75 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CLDN34	H7C241	214 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	AKR1C3	P42330	323 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610		Q9H3A6	140 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PDE6H	Q13956	83 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610		C9JCJ5	164 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GALR1	P47211	349 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	GNG4	P50150	75 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TAS2R60	P59551	318 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PSG9	Q00887	426 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610		H3BTX0	84 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	PEX7	O00628	323 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	MYCNOS	P40205	109 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1W2PS18	150 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ATG13-222	ENST00000534610	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ATG13-222	ENST00000534610	BUB3	O43684	328 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CRLF1	O75462	422 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ATG13-222	ENST00000534610	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52

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