RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DOK5Q9P104 306 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CELA1Q9UNI1 258 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RNF24Q9Y225 148 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RFNGQ9Y644 331 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.3□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 F6UB75 175 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HYPMO75409 117 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HBE1P02100 147 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AMBPP02760 352 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR5G3P0C626 314 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00869P0C866 280 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DLK1P80370 383 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FGL1Q08830 312 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF709Q8N972 641 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.29□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FNDC10F2Z333 226 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H3BRN7 92 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TSC22D2O75157 780 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 P0DMU3 169 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM231AP0DMU4 169 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM231CP0DMU5 169 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IL7P13232 177 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TAS2R30P59541 319 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PLP1P60201 277 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF846Q147U1 533 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RRN3P1Q2M238 152 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TEPPQ6URK8 271 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MITD1Q8WV92 249 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C20orf173Q96LM9 149 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.28□□□□□ -1.4
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A8MTW9 85 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 L7N2F9 121 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GOSR2O14653 212 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LYRM1O43325 122 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BTCP35070 178 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 VAMP2P63027 116 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF546Q86UE3 836 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF738Q8NE65 137 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM210BQ96KR6 192 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARL6Q9H0F7 186 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DKK2Q9UBU2 259 aa6.27□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 K7EPK0 472 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CCNKO75909 580 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 INSP01308 110 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 B2MP61769 119 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OXA1LQ15070 435 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AMTNQ6UX39 209 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RNF182Q8N6D2 247 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UHRF2Q96PU4 802 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GGACTQ9BVM4 153 aa6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A087X0K7 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C7orf66A4D0T2 115 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C5orf51A6NDU8 294 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM25EA8MYX2 175 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 M0R2Z0 102 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CCSO14618 274 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AGPAT2O15120 278 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PLA2G10O15496 165 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TCRBP04435 133 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HTN3P15516 51 aa6.25□□□□□ -1.41
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BCAP31P51572 246 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms