RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522336.5

CPEB4-209, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPEB4, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-209ENST00000522336 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.52□□□□□ -1.36
CPEB4-209ENST00000522336 C11orf52Q96A22 123 aa6.52□□□□□ -1.36
CPEB4-209ENST00000522336 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.52□□□□□ -1.36
CPEB4-209ENST00000522336 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.52□□□□□ -1.36
CPEB4-209ENST00000522336 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
CPEB4-209ENST00000522336 U3KQE9 123 aa6.52□□□□□ -1.36
CPEB4-209ENST00000522336 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TRBV12-3P01733 135 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 IGHV3-11P01762 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 CRYBA1P05813 215 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 CRYBB3P26998 211 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 MYCNOSP40205 109 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LEMD1Q68G75 181 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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CPEB4-209ENST00000522336 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.52□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 HIVEP1P15822 2718 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 F8P00451 2351 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 GGTLC3B5MD39 225 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 H3BQ15 152 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 BUB3O43684 328 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 IGLC2P0DOY2 106 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 NPPCP23582 126 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 CEBPGP53567 150 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 PDE6HQ13956 83 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 GPHB5Q86YW7 130 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 METTL26Q96S19 204 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 PARLQ9H300 379 aa6.51□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 MTORP42345 2549 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF727A8MUV8 499 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 INAFM1C9JVW0 142 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 K7EMT4 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 NDUFA7O95182 113 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TVP23CQ96ET8 276 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 NAT8Q9UHE5 227 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 A0A087X0K7 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF253O75346 499 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 CRLF1O75462 422 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 NDUFB4O95168 129 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPEB4-209ENST00000522336 RHEBQ15382 184 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LINC01006Q8NI28 216 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 BLNKQ8WV28 456 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 OTORQ9NRC9 128 aa6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 A0A1W2PS18 150 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 PGPA6NDG6 321 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 B4DEV8 164 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 C9JCJ5 164 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TCF21O43680 179 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 GALR1P47211 349 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 AWAT1Q58HT5 328 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 REC114Q7Z4M0 266 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 Q9H3A6 140 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 M0R036 132 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 LGALS9O00182 355 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TAS2R60P59551 318 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 PSG9Q00887 426 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 RPEL1Q2QD12 228 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.48□□□□□ -1.37
CPEB4-209ENST00000522336 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.48□□□□□ -1.37
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