RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PABPC1-218ENST00000521865 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.78□□□□□ -0.04
PABPC1-218ENST00000521865 LRTM2Q8N967 370 aa14.78□□□□□ -0.04
PABPC1-218ENST00000521865 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.78□□□□□ -0.04
PABPC1-218ENST00000521865 SMCO3A2RU48 225 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 M0R2Z0 102 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 SFT2D2O95562 160 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 INSP01308 110 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 Q6ZR54 194 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 PRSS46E5RG02 174 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 H3BMQ9 156 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 PPP1R1AQ13522 171 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 AMTNQ6UX39 209 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 RNF182Q8N6D2 247 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 TRIM63Q969Q1 353 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 ATG101Q9BSB4 218 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 PRM2P04554 102 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 RAP2BP61225 183 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF738Q8NE65 137 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 C17orf77Q96MU5 243 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 LYRM9A8MSI8 78 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 A8MTW9 85 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 IL5P05113 134 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 DEFB130BP0DP73 79 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 DEFB130AP0DP74 79 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 BAP18Q8IXM2 172 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 B2MP61769 119 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 RHOBP62745 196 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 PKD1P98161 4303 aa14.73□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 H3BRN7 92 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 OR5G3P0C626 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.72□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 F5H768 121 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 HYPMO75409 117 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 S100A5P33763 92 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF575Q86XF7 245 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 LINC01587Q99440 93 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 PSENENQ9NZ42 101 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 V9GYH0 126 aa14.71□□□□□ -0.05
PABPC1-218ENST00000521865 ADAP1O75689 374 aa14.7□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 NUDT3O95989 172 aa14.7□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 LINC00869P0C866 280 aa14.7□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 HTN1P15515 57 aa14.7□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.7□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 FCN2Q15485 313 aa14.69□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 S100A7AQ86SG5 101 aa14.69□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 UHRF2Q96PU4 802 aa14.69□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC160A6NGH7 325 aa14.68□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 SSSCA1O60232 199 aa14.68□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 AZU1P20160 251 aa14.68□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 TSPOP30536 169 aa14.68□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 C9orf170A2RU37 121 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 ATP5G1P05496 136 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 ATP5G3P48201 142 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 INPP1P49441 399 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 SELENOTP62341 195 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 ID3Q02535 119 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 PSG3Q16557 428 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 ARL6Q9H0F7 186 aa14.67□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 CXCL3P19876 107 aa14.66□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.66□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 RYR1P21817 5038 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 SCGB1D2O95969 90 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 CCL18P55774 89 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 TAS2R60P59551 318 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 C16orf74Q96GX8 76 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-218ENST00000521865 A0A087X0K7 114 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-218ENST00000521865 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms