RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 RPL12P30050 165 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 RPL29P47914 159 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 PSMB3P49720 205 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 CLINT1Q14677 625 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 MIC13Q5XKP0 118 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 ASB13Q8WXK3 278 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 UHRF2Q96PU4 802 aa13.21□□□□□ -0.29
FAAP20-215ENST00000514625 B2MP61769 119 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 OPCMLQ14982 345 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PATE2Q6UY27 113 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 C16orf92Q96LL3 132 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 LINC00052Q96N35 136 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PFDN5Q99471 154 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 HSPB11Q9Y547 144 aa13.2□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 KNCNA6PVL3 124 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 ISLRO14498 428 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PRR20EP86478 221 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PRR20CP86479 221 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PRR20DP86480 221 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PRR20BP86481 221 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PRR20AP86496 221 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 FGL1Q08830 312 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF709Q8N972 641 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.19□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 SPRY2O43597 315 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 LYL1P12980 280 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 DEFB135Q30KP9 77 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 ATP5SQ99766 215 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.18□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 SOCS3O14543 225 aa13.17□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.17□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.17□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 STAB2Q8WWQ8 2551 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 IFNA5P01569 189 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 SPP1P10451 314 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 RNF183Q96D59 192 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 RPRMQ9NS64 109 aa13.16□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.15□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.15□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.15□□□□□ -0.3
FAAP20-215ENST00000514625 TENM3Q9P273 2699 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 A0A087X0K7 114 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 HLA-DRB4P13762 266 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.14□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 H3BMM0 161 aa13.13□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 C17orf77Q96MU5 243 aa13.13□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 CXCL2P19875 107 aa13.12□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 LCN15Q6UWW0 184 aa13.12□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.12□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 MUC7Q8TAX7 377 aa13.12□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 MORN5Q5VZ52 161 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 C20orf173Q96LM9 149 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 AQP10Q96PS8 301 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 RARRES2Q99969 163 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 C3orf84H3BNL1 204 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 DEFB1P60022 68 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 FAM78BQ5VT40 261 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 RNF182Q8N6D2 247 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF738Q8NE65 137 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 HRH4Q9H3N8 390 aa13.1□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.09□□□□□ -0.31
FAAP20-215ENST00000514625 A0A0J9YX75 114 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms