RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 C12orf74Q32Q52 190 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM42Q69YG0 159 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TET1Q8NFU7 2136 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TOMM6Q96B49 74 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP19Q96LK0 163 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 CXCL16Q9H2A7 254 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL5AQ9Y689 179 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM159BA6NKW6 160 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PPBPP02775 128 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 SERPINE1P05121 402 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MSMBP08118 114 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R2P41236 205 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 HACD4Q5VWC8 232 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PXT1Q8NFP0 134 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MCFD2Q8NI22 146 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 VCX3BQ9H321 246 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MYH7BA7E2Y1 1941 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 AKAP13Q12802 2813 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 IRGMA1A4Y4 181 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 DOCK5Q9H7D0 1870 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFHX3Q15911 3703 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.49□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRSQ13332 1948 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ACACAQ13085 2346 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0D9SFI3 127 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2B3O76000 313 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF682O95780 498 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 GLO1Q04760 184 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 KISS1Q15726 138 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8NDZ9 215 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC7A6Q92536 515 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ENY2Q9NPA8 101 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO7AQ13402 2215 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MYH6P13533 1939 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 A8MT66 165 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 J3QQQ9 107 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 RBP1P09455 135 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 P0DMU3 169 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM231AP0DMU4 169 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM231CP0DMU5 169 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA12P43365 314 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 TPRXLQ17RH7 258 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZTI0 123 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT222Q8N1A0 295 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 CHST6Q9GZX3 395 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 SPG11Q96JI7 2443 aa3.46□□□□□ -1.85
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BRN7 92 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC22A1O15245 554 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM258P61165 79 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 OPTCQ9UBM4 332 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRK2Q5S007 2527 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 COL4A2P08572 1712 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GVG6 124 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNA10P01566 189 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 PRB1P04280 392 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 MOGQ16653 247 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-205ENST00000514178 TSC2P49815 1807 aa3.44□□□□□ -1.86
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