RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TVP23CQ96ET8 276 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 B4DEV8 164 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 M0QZ24 198 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFA7O95182 113 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PYYP10082 97 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RANP62826 216 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OTORQ9NRC9 128 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NAT8Q9UHE5 227 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1B0GUS0 222 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HELTA6NFD8 242 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9JQL5 133 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INAFM1C9JVW0 142 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7EMT4 169 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GP9P14770 177 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRYBB3P26998 211 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP5G3P48201 142 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RHEBQ15382 184 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MORN5Q5VZ52 161 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LEMD1Q68G75 181 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ESM1Q9NQ30 184 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOTCH2Q04721 2471 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZANQ9Y493 2812 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PGPA6NDG6 321 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H3BQ15 152 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRLF1O75462 422 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFB4O95168 129 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AKR1C3P42330 323 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF503Q96F45 646 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR5B12Q96R08 314 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PARLQ9H300 379 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BUB3O43684 328 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF253O75346 499 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2G1P62253 170 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C11orf52Q96A22 123 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q9H3A6 140 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BIN3Q9NQY0 253 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PEMTQ9UBM1 199 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LGALS9O00182 355 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PEX7O00628 323 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MT-ND4LP03901 98 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLC2P0DOY2 106 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADCYAP1P18509 176 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GNG4P50150 75 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TAS2R60P59551 318 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1QL4Q86Z23 238 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATG101Q9BSB4 218 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPDR1Q9UM22 224 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNF114Q9Y508 228 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACANP16112 2415 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A087X0K7 114 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC01619G3V211 115 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HAX1O00165 279 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADIRFQ15847 76 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GUCA2BQ16661 112 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 REC114Q7Z4M0 266 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 U3KQE9 123 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms