RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512881.5

RFC1-215, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-215	ENST00000512881	TCTA	P57738	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	AP3S2	P59780	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF90	Q03938	601 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	FABP1	P07148	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	IAPP	P10997	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SLC25A6	P12236	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TIRAP	P58753	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	RAB11A	P62491	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	OR2F1	Q13607	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881		Q6ZTC4	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	MED6	O75586	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SFT2D2	O95562	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	HOXB5	P09067	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ID1	P41134	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	DEFB1	P60022	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	LYZ	P61626	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TRGV9	Q99603	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881		V9GYH0	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	RYR1	P21817	5038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	WRB	O00258	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SOCS3	O14543	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SYNGR2	O43760	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	S100A5	P33763	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PSMB3	P49720	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	FXYD7	P58549	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF79	Q15937	498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PKD1	P98161	4303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ISLR	O14498	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	ORM2	P19652	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	EMP1	P54849	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	PSG9	Q00887	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFC1-215	ENST00000512881	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms