RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507063.1

NEDD4-206, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4, Length 457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4-206	ENST00000507063	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RBKS	Q9H477	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ATG12	O94817	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SLC25A4	P12235	298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NPY1R	P25929	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	GABARAP	O95166	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	IFNA21	P01568	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	AZU1	P20160	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TAS2R19	P59542	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	LYZ	P61626	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SPCS2	Q15005	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ZNF79	Q15937	498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	LGI3	Q8N145	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	HERC1	Q15751	4861 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063		A0A0J9YX75	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063		M0R2Z0	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RGS5	O15539	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	IAPP	P10997	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	AKR1C4	P17516	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TBP	P20226	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	PSG9	Q00887	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	COTL1	Q14019	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	FAT1	Q14517	4588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	S100A1	P23297	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	ID1	P41134	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	PSMB3	P49720	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	CCR6	P51684	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	DAD1	P61803	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	IL18	Q14116	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4-206	ENST00000507063	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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