RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A1B0GV90	55 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C20orf202	A1L168	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		A8MWL6	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		E7EQL1	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458		E7EUB6	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	BMPR1B	O00238	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC25A17	O43808	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF253	O75346	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FCN3	O75636	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	TOMM40	O96008	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	UBE2G1	P62253	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CDSN	Q15517	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SERF1A-204	ENST00000504458	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A1B0GXF2	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A1W2PS18	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SRI	P30626	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	REG1B	P48304	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MMD	Q15546	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CFHR4	Q92496	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SMR3A	Q99954	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	FOXC2	Q99958	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A1B0GUS0	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		A0A1B0GW15	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PGP	A6NDG6	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LTA	P01374	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TCRA	P04437	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PYY	P10082	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	GP9	P14770	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PMCH	P20382	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	AMT	P48728	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MFAP2	P55001	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	FXYD3	Q14802	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TNXA	Q16473	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NEU1	Q99519	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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