RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A6P12236 298 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ORM2P19652 201 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 C20orf173Q96LM9 149 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RYR1P21817 5038 aa8.52□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 LYRM9A8MSI8 78 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 WRBO00258 174 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SYNGR2O43760 224 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 VAMP1P23763 118 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TNFSF8P32971 234 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ALDH3B2P48448 385 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 AP3S2P59780 193 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 A8MTW9 85 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 INSP01308 110 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB130BP0DP73 79 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB130AP0DP74 79 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TMBIM6P55061 237 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 AKR1C1Q04828 323 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 FGL1Q08830 312 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 AMTNQ6UX39 209 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 LRTM2Q8N967 370 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SOSTQ9BQB4 213 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 F5H768 121 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 M0R2Z0 102 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TSPOP30536 169 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RAP2BP61225 183 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 S100A7AQ86SG5 101 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 IL5P05113 134 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 HOXB5P09067 269 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RHOBP62745 196 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 PYDC2Q56P42 97 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF575Q86XF7 245 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RNF182Q8N6D2 247 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF738Q8NE65 137 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 MCFD2Q8NI22 146 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 C17orf77Q96MU5 243 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01587Q99440 93 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 NACAE9PAV3 2078 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SMCO3A2RU48 225 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 CBY3A6NI87 242 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS46E5RG02 174 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 HYPMO75409 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SFT2D2O95562 160 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 NUDT3O95989 172 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 PRM2P04554 102 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ATP5G1P05496 136 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 HTN1P15515 57 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ATP5G3P48201 142 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 CCL18P55774 89 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 RNF24Q9Y225 148 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 H3BP45 60 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 OR5G3P0C626 314 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 AZU1P20160 251 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SELENOTP62341 195 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 FCN2Q15485 313 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 BAP18Q8IXM2 172 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N3U1 123 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 C16orf90A8MZG2 172 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 H3BRN7 92 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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