RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	ATG12	O94817	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	INS	P01308	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	PRM2	P04554	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	PGAM2	P15259	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	RCVRN	P35243	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	RND3	P61587	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	NRAC	Q8N912	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426		Q9H8V8	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426		A8MTW9	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426		M0R2Z0	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	ISLR	O14498	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	PSG1	P11464	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	PRSS3	P35030	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	XG	P55808	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	PIGP	P57054	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	SPCS3	P61009	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	DOK5	Q9P104	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BBS9-213	ENST00000495426	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ELK1	P19419	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	UCP1	P25874	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TSPO	P30536	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00315	P59091	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LYZ	P61626	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	FCN2	Q15485	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TGFBR1	P36897	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	MEOX2	P50222	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	B2M	P61769	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SP6	Q3SY56	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426		A0A0J9YY99	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	HOXB5	P09067	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	AZU1	P20160	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF90	Q03938	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-213	ENST00000495426	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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