RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 C5P01031 1676 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 CLTCL1P53675 1640 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 NAV1Q8NEY1 1877 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 IRGMA1A4Y4 181 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 M0R2Z0 102 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 LEPROTO15243 131 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 SRIP30626 198 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 ATP5G3P48201 142 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.76□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 TEX261Q6UWH6 196 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 MUC7Q8TAX7 377 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 FGF13Q92913 245 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 ISOC1Q96CN7 298 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 OR8B2Q96RD0 313 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 DERL1Q9BUN8 251 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 IMUPQ9GZP8 106 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 POPDC3Q9HBV1 291 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 RGPD5Q99666 1765 aa2.76□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 CCDC18Q5T9S5 1454 aa2.76□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 SCTP09683 121 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 HLA-DMBP28068 263 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 NUP35Q8NFH5 326 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 OR5H6Q8NGV6 325 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 CLDND2Q8NHS1 167 aa2.75□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 MED11Q9P086 117 aa2.75□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.75□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 C10orf71Q711Q0 1435 aa2.75□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.74□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.74□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.74□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 MSRB3Q8IXL7 192 aa2.74□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.74□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 GINS4Q9BRT9 223 aa2.74□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 CACNA1SQ13698 1873 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa2.73□□□□□ -1.97
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CCL20-204ENST00000489160 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PQD3 144 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 TMEM218A2RU14 115 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 C17orf98A8MV24 154 aa2.73□□□□□ -1.97
CCL20-204ENST00000489160 C9JAW5 83 aa2.73□□□□□ -1.97
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