RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 IGHV3-23P01764 117 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CTSGP08311 255 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 ATP5G2Q06055 141 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 TMEM86BQ8N661 226 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 C14orf144Q96I85 54 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 MS4A10Q96PG2 267 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 PAXXQ9BUH6 204 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 COLCA2A8K830 154 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 TRGV3P03979 118 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 IL4P05112 153 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 ATP5G3P48201 142 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CFHR3Q02985 330 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 SCGB2A2Q13296 93 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 Q6ZS46 218 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 USMG5Q96IX5 58 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CCDC140Q96MF4 163 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 A0A1W2PRE2 83 aa9.86□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 H3BQ15 152 aa9.86□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 IGLV1-40P01703 118 aa9.86□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 GPR183P32249 361 aa9.86□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.86□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 H3BRN7 92 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 HAX1O00165 279 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 OR10J4P0C629 311 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 S100A7P31151 101 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 ADMP35318 185 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 TPPP2P59282 170 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 ZFP82Q8N141 532 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 FXYD5Q96DB9 178 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 RNF24Q9Y225 148 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 ZNF727A8MUV8 499 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 TGOLN2O43493 480 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CLEC3BP05452 202 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 PYYP10082 97 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 GP9P14770 177 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 RHEBQ15382 184 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 AWAT1Q58HT5 328 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 REC114Q7Z4M0 266 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 TVP23CQ96ET8 276 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 JMJD8Q96S16 334 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.85□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 PARLQ9H300 379 aa9.85□□□□□ -0.83
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NELFE-209ENST00000488426 M0R036 132 aa9.84□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 DNLZQ5SXM8 178 aa9.84□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.84□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 C11orf52Q96A22 123 aa9.84□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NELFE-209ENST00000488426 A0A0G2JLM5 398 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 BMPR1BO00238 502 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 IGHG4P01861 327 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 PF4V1P10720 104 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 ZNF702PQ9H963 129 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 NAT8Q9UHE5 227 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 NPPCP23582 126 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 Q8N2B8 174 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 RABAC1Q9UI14 185 aa9.83□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 B4DEV8 164 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 GGTLC3B5MD39 225 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.82□□□□□ -0.84
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NELFE-209ENST00000488426 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 LEMD1Q68G75 181 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 C3orf56Q8N813 242 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 GNB4Q9HAV0 340 aa9.82□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 NDUFB4O95168 129 aa9.81□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
NELFE-209ENST00000488426 PSMB8P28062 276 aa9.81□□□□□ -0.84
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