RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487428.1

PTPRE-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, human

TSL 3

Gene PTPRE, Length 325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRE-209	ENST00000487428	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	PRR25	Q96S07	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MB	P02144	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	C1QB	P02746	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	CD7	P09564	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ORM2	P19652	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ID1	P41134	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	CLINT1	Q14677	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	M6PR	P20645	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428		Q6ZWC4	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ARPC5	O15511	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SPP1	P10451	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	TAS2R45	P59539	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	RHOB	P62745	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	APOC4	P55056	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	DEFB131A	P59861	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRE-209	ENST00000487428	HAGH	Q16775	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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