RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486587.1

LRSAM1-208, Transcript of leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1, human

TSL 3

Gene LRSAM1, Length 827 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	RPRM	Q9NS64	109 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	CENPX	A8MT69	81 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	AMBP	P02760	352 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	TCTA	P57738	103 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR5G3	P0C626	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	DLK1	P80370	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SMIM8	Q96KF7	97 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	NEU1	Q99519	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	RNF126	Q9BV68	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	DNAH2	Q9P225	4427 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587		M0R2Z0	102 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLA2G10	O15496	165 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	RAP2B	P61225	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARL16	Q0P5N6	197 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	LYRM1	O43325	122 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	HYPM	O75409	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	PRM2	P04554	102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	HTN3	P15516	51 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	GPR82	Q96P67	336 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARL6	Q9H0F7	186 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		12.79	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM25E	A8MYX2	175 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	HBE1	P02100	147 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
LRSAM1-208	ENST00000486587	C7orf66	A4D0T2	115 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587		A8MTW9	85 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	TSC22D2	O75157	780 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	PATE2	Q6UY27	113 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	NUDT15	Q9NV35	164 aa		12.77	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	SELENOT	P62341	195 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	TEPP	Q6URK8	271 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARV1	Q9H2C2	271 aa		12.76	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587		H3BTX0	84 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	INS	P01308	110 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	TCRB	P04435	133 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	S100A7	P31151	101 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLP1	P60201	277 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	MGST2	Q99735	147 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		12.75	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	HERC2	O95714	4834 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587		K7EPK0	472 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587		L7N2F9	121 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	AGPAT2	O15120	278 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	CXCL3	P19876	107 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	TAS2R30	P59541	319 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	VAMP2	P63027	116 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	MORN5	Q5VZ52	161 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF546	Q86UE3	836 aa		12.74	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587	PKHD1	P08F94	4074 aa		12.73	□□□□□ -0.37
LRSAM1-208	ENST00000486587		A0A087X0K7	114 aa		12.73	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156 ms