RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 LILRB2Q8N423 598 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 PSENENQ9NZ42 101 aa5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 DEFB4AO15263 64 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 SSSCA1O60232 199 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 P0DMU3 169 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 FAM231AP0DMU4 169 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 FAM231CP0DMU5 169 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MIFP14174 115 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 PAX9P55771 341 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 DEFA1P59665 94 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 DEFA3P59666 94 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 Q6ZTC4 211 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 ENKURQ8TC29 256 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 C2orf50Q96LR7 162 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.52□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 AGRNO00468 2067 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 C7orf66A4D0T2 115 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 ISLRO14498 428 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 HLA-DMBP28068 263 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 PSMB3P49720 205 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 DEFB131AP59861 70 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF90Q03938 601 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 AKR1C1Q04828 323 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IL15RAQ13261 267 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 TEPPQ6URK8 271 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 Q6ZR54 194 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF546Q86UE3 836 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 STHQ8IWL8 128 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 X6R8D5 127 aa5.51□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 H3BP45 60 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CDK2AP2O75956 126 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 GALR1P47211 349 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 LYZP61626 148 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 HBG1P69891 147 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 HBG2P69892 147 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 VWC2Q2TAL6 325 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 NMES1Q9C002 83 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.5□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 A0A087X0K7 114 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 C5orf51A6NDU8 294 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF98A6NK75 572 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 A8MTW9 85 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 H3BRN7 92 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 L7N2F9 121 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 SOCS3O14543 225 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 MPDU1O75352 247 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 SCGB1D2O95969 90 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF688P0C7X2 276 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 HLA-DRB4P13762 266 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 CXCL2P19875 107 aa5.49□□□□□ -1.53
RBBP4-211ENST00000477563 S100A11P31949 105 aa5.49□□□□□ -1.53
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