RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475614.6

CCDC30-208, Transcript of coiled-coil domain containing 30, human

TSL 2

Gene CCDC30, Length 1,001 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC30-208	ENST00000475614	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	MGST2	Q99735	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ATP5S	Q99766	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		G3V4G9	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CHEK1	O14757	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SAP30	O75446	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	DFFB	O76075	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	YIF1A	O95070	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IL4	P05112	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR2F1	Q13607	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CLINT1	Q14677	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	MLX	Q9UH92	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	AGRN	O00468	2067 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		A0A1W2PS18	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ARPC5	O15511	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	BUB3	O43684	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C1QB	P02746	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CD5	P06127	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FGF7	P21781	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NPPC	P23582	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CAMLG	P49069	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RAB31	Q13636	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	METTL26	Q96S19	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		H3BRN7	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TAAR5	O14804	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TSPAN4	O14817	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IFNA5	P01569	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CXCL2	P19875	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	BMI1	P35226	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	LYZ	P61626	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	B2M	P61769	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CD300C	Q08708	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF266	Q14584	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RNF2	Q99496	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		A0A0D9SG52	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms