RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470143.1

NOP56-210, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-210ENST00000470143 WRBO00258 174 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 TSPOP30536 169 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 PLP1P60201 277 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 PPP1R1AQ13522 171 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 PYDC2Q56P42 97 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 LYRM9A8MSI8 78 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SELENOTP62341 195 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 CCDC190Q86UF4 302 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SLC25A22Q9H936 323 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 FNDC10F2Z333 226 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 H3BRN7 92 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 M0R2N4 97 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 HOXB5P09067 269 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 ORM2P19652 201 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 DAD1P61803 113 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 S100A7AQ86SG5 101 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 RNF24Q9Y225 148 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 A0A087X0K7 114 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 K7EPK0 472 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 INSP01308 110 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 S100A5P33763 92 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 AKR1C1Q04828 323 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 C4orf46Q504U0 113 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 SMIM8Q96KF7 97 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.47□□□□□ -0.89
NOP56-210ENST00000470143 C9orf170A2RU37 121 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 HYPMO75409 117 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 IL5P05113 134 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 RAP2BP61225 183 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.46□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 HSPG2P98160 4391 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 H3BP45 60 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 NDUFB6O95139 128 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 HTN3P15516 51 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 DLK1P80370 383 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 PSENENQ9NZ42 101 aa9.45□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 M0R2Z0 102 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 ADAP1O75689 374 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 LINC00869P0C866 280 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 CXCL2P19875 107 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 CXCL3P19876 107 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TAS2R30P59541 319 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 RNF182Q8N6D2 247 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 SRRQ9GZT4 340 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.44□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 CBY3A6NI87 242 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TAS2R60P59551 318 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 PSG3Q16557 428 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 ZNF738Q8NE65 137 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 GGACTQ9BVM4 153 aa9.43□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 SMCO3A2RU48 225 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TSC22D2O75157 780 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 OR4E1P0C645 316 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 TEPPQ6URK8 271 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 PATE2Q6UY27 113 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 BAP18Q8IXM2 172 aa9.42□□□□□ -0.9
NOP56-210ENST00000470143 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms