RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468852.2

MKNK1-208, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 3

Gene MKNK1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-208	ENST00000468852	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	FOLR2	P14207	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SORL1	Q92673	2214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	IFITM2	Q01629	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	HELT	A6NFD8	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	CXorf1	O96002	111 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	HBE1	P02100	147 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	GALR1	P47211	349 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	INSL3	P51460	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	CD33	P20138	364 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	FHIT	P49789	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MEOX2	P50222	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MKNK1-208	ENST00000468852	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852		A0A087X0K7	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	RGS13	O14921	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	OR7C2	O60412	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	GP9	P14770	177 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	EDN2	P20800	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	LEMD1	Q68G75	181 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	MLX	Q9UH92	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	SAP30	O75446	220 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	RAB14	P61106	215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	GUK1	Q16774	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	HRH4	Q9H3N8	390 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	GCHFR	P30047	84 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	PSMB3	P49720	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	PPT1	P50897	306 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	PDE6H	Q13956	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	ANK2	Q01484	3957 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	TSPAN4	O14817	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF253	O75346	499 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MKNK1-208	ENST00000468852	NMB	P08949	121 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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