RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 OR7C2O60412 319 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV3-48P01763 117 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 MT-ND6P03923 174 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 HNF1AP20823 631 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ERVFC1-1P60608 527 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 CENPWQ5EE01 88 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ATP6V0E1O15342 81 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 WDR73Q6P4I2 378 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF503Q96F45 646 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 CRYBB3P26998 211 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.6□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ISLRO14498 428 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 TPPP2P59282 170 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 TAS2R60P59551 318 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 RAB4BP61018 213 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 RANP62826 216 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.58□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 PSMB11A5LHX3 300 aa14.58□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 G3V318 75 aa14.58□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 SLC17A3O00476 420 aa14.58□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 CRISP2P16562 243 aa14.58□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 Q0VG73 95 aa14.58□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ECSCRQ19T08 205 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 MS4A10Q96PG2 267 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 NF1P21359 2839 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 GGTLC3B5MD39 225 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 CBLN1P23435 193 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 THAP8Q8NA92 274 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 MISP3Q96FF7 219 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 NAGKQ9UJ70 344 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SSTP61278 116 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 ESM1Q9NQ30 184 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 HIVEP2P31629 2446 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SNURFLB1AK76 121 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 INAFM1C9JVW0 142 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 COX7A2P2O60397 106 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SCGB1D1O95968 90 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TEX29Q8N6K0 151 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 OR5I1Q13606 314 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 IGLV2-8P01709 118 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 S4R3C0 116 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 IGHG2P01859 326 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 CRYGCP07315 174 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM160Q9NX00 188 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.53□□□□□ -0.08
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CAPN3-209ENST00000466222 SRD5A1P18405 259 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 RASL11AQ6T310 242 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 PAXXQ9BUH6 204 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPN3-209ENST00000466222 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPN3-209ENST00000466222 BAGE3Q86Y29 109 aa14.52□□□□□ -0.09
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