RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 RHODO00212 210 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 REG1AP05451 166 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 IFITM1P13164 125 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 COL10A1Q03692 680 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 PMCHL1Q16048 86 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 Q6ZVH6 145 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 OR8S1Q8NH09 359 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4A5Q8NH83 315 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 TVP23CQ96ET8 276 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 SEC22AQ96IW7 307 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 PARLQ9H300 379 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 KLK11Q9UBX7 282 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.85□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM262E9PQX1 116 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM250H0YL14 139 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPB6O14558 160 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 NPFFO15130 113 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 TAS2R46P59540 309 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF146Q15072 292 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM201AQ5SY85 155 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 TM2D2Q9BX73 214 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 IL36GQ9NZH8 169 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.84□□□□□ -1.47
RPUSD3-212ENST00000466141 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PPK0 400 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 SRRM5B3KS81 715 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 J3QLW9 94 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 VCYO14598 125 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 CA2P00918 260 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 LHBP01229 141 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 REG1BP48304 166 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 KRTAP10-3P60369 221 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 CDK5R1Q15078 307 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 SPHARQ15513 63 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 Q6AWC8 147 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 C1RLQ9NZP8 487 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 MDFICQ9P1T7 246 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF7Q9UBF6 113 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 CTSZQ9UBR2 303 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1B0GV50 99 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 GABARAPH6UMI1 98 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 NDUFC2O95298 119 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DS2P43631 304 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 FOXI1Q12951 378 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 Q6ZPA2 131 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 Q6ZUT4 128 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 LRRC29Q8WV35 223 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 ARPC1AQ92747 370 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.82□□□□□ -1.48
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