RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 HELTA6NFD8 242 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 F6UB75 175 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BMM0 161 aa5.1□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 AGPAT2O15120 278 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 L7N2F9 121 aa5.09□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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RABGEF1-206ENST00000461017 VWC2Q2TAL6 325 aa5.08□□□□□ -1.6
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR11H2Q8NH07 326 aa5.08□□□□□ -1.6
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RABGEF1-206ENST00000461017 SULT1A1P50225 295 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGEF1-206ENST00000461017 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF182Q8N6D2 247 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF709Q8N972 641 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8NAQ8 132 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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