RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 K7EN84 100 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TSPAN13O95857 204 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CATR1Q13166 79 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 JMJD8Q96S16 334 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SPATA25Q9BR10 227 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MED13LQ71F56 2210 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 J3KRW8 73 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 Q6ZRM9 215 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 A0A1W2PPM0 123 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IGKV1-5P01602 117 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 DEFA4P12838 97 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TCL1AP56279 114 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 HERV-K104P63124 156 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 RAB37Q96AX2 223 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C9JCJ5 164 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 STAG3L2P0CL84 134 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 DLX1P56177 255 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 KIR3DS1Q14943 382 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FAM168AQ92567 244 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 C1RLQ9NZP8 487 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 APCP25054 2843 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LEPROTL1O95214 131 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 SNAI2O43623 268 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 FCGR3BO75015 233 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 COX8AP10176 69 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 G6PCP35575 357 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 GNG4P50150 75 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 DDB2Q92466 427 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-210ENST00000453727 CXorf1O96002 111 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 LIPFP07098 398 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 DPF1Q92782 380 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 PSG8Q9UQ74 426 aa6.84□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 FXYD3Q14802 87 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 LINC00311Q8N616 119 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 S1PR3Q99500 378 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 OSTCQ9NRP0 149 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 HELTA6NFD8 242 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 H0Y8G0 127 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 CNIH1O95406 144 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 P0C879 139 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 CT45A6P0DMU7 189 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 CT45A5P0DMU8 189 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 CT45A7P0DMV0 189 aa6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LMO3-210ENST00000453727 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms